在我们的日常生活中，我们都是这样做的。Bakteeri- ja siene - infktiosairauksien hoito perustuu erityisesti antimikrobilääkkeisiin, kun taas virusinfktioiden hoidossa keskitytään用于oireiden lieventämiseen。
infktioiden hoito aloitetaan在parhaaseen中使用käytännön tietoon perustuvalla lääkityksellä ilman täydellistä ymmärrystä sen tehosta。网址:erinäisiä testejä， pääsääntöisesti hoidon vaikuttavuutta tarkastellaan kuitenkin seuraamalla infktio -oireita。
uusimat sekvensointitekniikat ovat arkipäiväistäneet perimien ja niiden ilmentymistuotteiden kartoitukset。Tekniikat ovat myös mahdollistaneet mikrobistojen kuvaamisen janta - ja geenitasolla。Nykykäytännössä mikrobistotason sekvensointia kuitenkin hyödynnetään harvoin infektioiden hoitovasteen arvioimisessa。
赫尔辛基人民共和国的图基亚亚ovat kehittäneet yhdessä HUSin kanssa uudenlasta sekvensointin perustuvaa menetelmää infektiosairauksien osoituku seen a niiden hoitasteen arvioin。Menetelmän kuvaus ja alustavat tulokset sen hyödyntämisestä haavainfektion hoitovasteen arviointin on julkaistu临床微生物学与感染-lehdessa。
- Menetelmän avulla infktiokudoksesta voidan kartoittaa aktiivisina olevat mikrobit ja niiden geenitoimta ilman tuloksia vääristäviä välivaiheita。Menetelmällä voidan tutkia mikrobien lääkeresistenssimekanismien ja muiden hoidon kanalta olennaisten生物学家sten mekanismien tomintaa rotettavasti感染aikana tai hoidon jälkeen。Sen avulla on mahdollista ymmärtää nopeasti, ovatko aiheuttajamikrobit vähentymässä vai lisääntymässä， kertoo bioinformaatikko, filosofian tohtori马蒂·KankainenHelsingin yliopistosta。
Menetelmällä saatiin tieto taudinaiheuttajan poistumisesta ja osoitettiin normalisoituminen
Kehitetty ratkaisu toimii seuraavasti: potilaasta otetaan tulehdusnäyte, josta eristetään biology sten toimintojen perustana olevat gei -ilmentymistuotteet eli näytteen RNA。Tämän jälkeen mikrobiperäinen RNA rikastetaan, jotta taudinaiheuttajista saadaan mahdollisimman paljon tietoa。RNA luetaan sekvensoimalla, ja lopuksi saatu suuri tietomäärä分析其他算法。
祝你生日快乐。Tutkimuskohteena oli palovamma, jonka hava -aluetta oli homella eri antibioottihoidolla tuloksetta jo lähes sadan päivän ajan。我爱你，我爱你。Neljännen antibiottihoidon aloituksen jälkeen tutkijat ottivat potilaalta tutkimusnäytteet。Niihin sovellettiin sekä project jektissa kehitettyä ratkaisua että yleisemmin käytettävää 16S rRNA -geenin monistusta ja sekvensointia。Vastaavat näytteet kerättiin myös kontrollipotilaalta。
Neljäs antibiottihoito osoittautui tehokkaaksi，是的vähensi potilaan oireita merkittävästi。Uudella menetelmällä saadut tulokset vastasivat potilaan kliinistä tilannekuvaa ja vahvistivat taudinaiheuttajan poistumisen。Lisäksi一个正态分布。在哈韦图16s -图特基穆塞萨，它是一个正常的城市。Mikrobien DNA:n melko hitaan hajoamisen takia vertailumenetelmällä tosin voitiin tunnistaa jo eliminoiduksi tulleet viimeisimmät todennäköiset taudinaiheuttajat。
Metatranskriptomiikasta vastaus myös infktiosairauksien diagnostiikkaan?
Tutkimuksessa käytettyä lähestymistapaa eli mikrobi-ilmentymistuotteiden kokonaisvaltaista selvittämistä kutsutaan metatranskriptomiikaksi。森käyttö lisääntynyt viime aikoina, mutta infktiokudosten analysoinin hankaluus ja kudosten vähäiset mikrobimäärät ovat kuitenkin estäneet metatranskriptomiikan kliinisen hyödyntämisen laajamittaisesti。
- Tutkimuksemme tulokset osoittavat, että sekvensointipohjainen ratkaisu soveltuu myös hankalien ja erittäin pieniä mikrobimääriä sisältävien näytteiden analysointinin。Taudinaiheuttajien tunnistamisen lisäksi senavulla voidan kartoittaa mikrobi-isäntävuorovaikutuksia uudella tavalla ja löytää vielä tuntemattomia tautimekanismeja。Jatkamme menetelmän kehittämistä laboratorossamme käynnissä olevien laajempien potilastutkimusten avulla。Lisäksi selvitämme tekniikan eri sovellusmahdollisuuksia, sanoo Helsingin yliopiston farmakologian dosenttiEsko Kankuri．
Infektionäytteille sovelletun ratkaisun kehityksestä vastasi Helsingin yliopisttutkijatotoriTeija Ojala．Seuraavaksi Ojala hyödyntää luomaansa menetelmää koronaviruksen aiheuttamien virusinfktioiden molekyylibiologian ymmärtämiseen。
Tutkimusta rahoittivat Suomen Kulttuurirahasto ja Suomen Akatemia。Tutkimus on myös osa Helsingin yliopiston antibioottiresistance situtkimukseen liittyvää HiLIFE-kärkihanketta。Ratkaisun jatkokehitys ja tuotteistaminen on käynnistetty Business Finland rahoittamassa yhteistyöprojektissa Perkin Elmer Finland Oy:n, Immuno Diagnostic Oy:n, VM-IT Oy:n, Orinoco Oy:n, kanssa。
Lisatietoja:
Matti Kankainen, FT, Helsingin yliopisto & HUS Diagnostiikkakeskus
050 428 6527
Sahkoposti:matti.kankainen@helsinki.fi
Esko Kankuri, dosentti, Helsingin yliopisto
040 703 7338
Sahkoposti:esko.kankuri@helsinki.fi
Viite: Teija Ojala, Andrew Lindford, Kirsi Savijoki, Heli Lagus, Jenni Tommila, Alan Medlar, Pentti Kuusela, Pekka Varmanen, Liisa Holm, Jyrki Vuola, Esko Kankuri, Matti Kankainen。烧伤创面感染清除的meta切片评估。Microbiol感染。2020.DOI:10.1016 / j.cmi.2020.07.021。