当病毒在人类体内复制时,它的基因组会出现微小的变化,称为突变。尽管这些变化中的大多数不影响病毒的主要特征,如致病性,但当我们追踪病毒的地理分布、易变性和目前在人群中流行的病毒数量时,可以利用这些变化。
研究人员正计划对赫尔辛基大学医院(HUS)地区几乎所有阳性COVID-19样本的SARS-CoV-2病毒基因组进行测序。
测序信息将很快在开源数据库中发布,以便与其他研究人员和专家组织共享信息。目前,许多国家正在同时研究SARS-CoV-2基因组,这使得几乎可以实时跟踪突变。
“通过观察已确诊的COVID-19病例患者的整个病毒基因组,可以在全国范围内监测病毒的变化,以了解病毒是如何传播的,以及是否出现了不同的毒株。我们也可以更好地为未来的流行病做准备Ravi Kant赫尔辛基大学教授。bob体育下注安卓版
到目前为止,研究人员已经对40多个芬兰SARS-CoV-2病毒序列进行了测序。在SARS-CoV-2传入芬兰的早期,所有的病毒都是输入的,主要来自意大利。到3月的第二周,当比较序列时,可以看到清晰的聚类,这表明疾病已经开始在芬兰人群中传播。
“通过研究这些SARS-CoV-2序列,我们可以以非常高的分辨率跟踪从输入开始的不同谱系的进化。关于输入——特别是如果未来发生第二波流行,例如明年秋天,区分本地传播的病毒和我们很容易识别的输入病例是很重要的,”DrTeemu Smura他领导着病毒性人畜共患病小组的测序工作。
现在,由教授领导的病毒性人畜共患病小组的研究人员奥利Vapalahti赫尔辛基大学病毒学系与芬兰分子医学研究所(FIMM)和生物技术bob体育下注安卓版研究所(BI)合作。
这使得几乎所有可用样本的测序成为可能。研究人员正在使用高通量测序,大约需要2到3天来准备序列。
COVID-19网站列出了研究人员在冠状病毒危机期间的当前项目
Ravi Kant博士说:“芬兰各地的研究人员正在共同努力抗击COVID-19。
的COVID-19集团赫尔辛基大学的bob体育下注安卓版研究就是一种合作形式。他们的网站概述了与赫尔辛基大学医院(HUS)和芬兰健康与福利研究所(THL)合作应对正在发生的COVID-19大流行的研究人员和研究小组所做的努力。
这个项目的网站描述了关于冠状病毒的几个研究项目。
阅读更多:病毒测序
进一步的信息:
Teemu Smura,赫尔辛基大学bob体育下注安卓版博士
电话+358 2941 26480
电子邮件:teemu.smura@helsinki.fi
Ravi Kant,博士,赫尔辛bob体育下注安卓版基大学
电话+358 2941 57054
电子邮件:ravi.kant@helsinki.fi
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