人类免疫防御是基于白细胞准确识别疾病导致病原体的能力,并引发防御反应。免疫防御能够召回以前遇到的病原体,例如,疫苗的有效性是基于的。因此,免疫防治是具有个人患者历史的最准确的患者记录系统。然而,此信息以前难以从患者样本中获得。
学习免疫系统大致可以分为两部分,其中B细胞负责产生针对病原体的抗体,而T细胞负责破坏它们的目标。用传统实验室方法测量抗体相对简单,这就是抗体在医疗保健中已经有多种用途的原因。
“虽然已知T细胞在防御反应中的作用反对例如病毒和癌症是必不可少的,但鉴定了尽管研究的广泛研究,但鉴定了T细胞的靶标。”satu nustjoki.,翻译血液学教授。
ai有助于识别新的键锁对
T细胞在键和锁定原理中识别它们的靶,其中键是T细胞表面上的T细胞受体,并且键是呈现在感染细胞表面上的蛋白质。估计个人携带更不同的T细胞键,而不是银河系中的恒星,使T细胞靶标具有繁琐的实验室技术。
因此,Aalto University和赫尔辛基大学的研究人员已经研究了以前分布bob体育下注安卓版的钥匙锁对,并且能够创建可以预测先前未映射的T细胞的目标的AI模型。
“我们创建的AI模型是灵活的,适用于每种可能的病原体 - 只要我们有足够的实验生产的钥匙锁对。例如,当有足够数量的这种对的这种成对的这种成对时,我们迅速将我们的模型应用于Coronavirus SARS-COV-2,“解释说emmi jokinen,M.Sc.和博士。Aalto大学的学生。
该研究的结果有助于我们了解T细胞如何应用其关键的不同部分来识别其锁。研究人员研究了哪些T细胞识别常见病毒,如流感,Hi-和乙型肝炎。研究人员还利用了他们的工具来分析鉴定乙型肝炎的T细胞的作用,这在肝炎进展到肝细胞癌后失去了杀伤能力。
该研究已在科学期刊上发表PLOS计算生物学。
用新型AI型号发布数据的新生活
AI生成的工具是具有成本效益的研究主题。
“在这些工具的帮助下,我们能够更好地利用已发表的众多患者队列并获得额外的理解,”指出哈里Lahdesmaki,Aalto大学的计算生物学和机器学习教授。
使用人工智能工具,研究人员借出了防御反应的强度与其在不同疾病状态中的目标相关,没有这项研究,这是不可能的。
“例如,除了Covid19感染之外,我们还调查了防御系统在各种自身免疫疾病发展中的作用,并解释了为什么一些癌症患者受益于新药和一些不”,揭示了M.D。Jani Huhtanen.,博士。赫尔辛基大学的学生,关于即将到bob体育下注安卓版来的新模型的工作。
更多的信息
M.D.Jani Huhtanen,赫尔辛bob体育下注安卓版基大学
电话。+358 50 4350 191,电子邮件:Jani.huuhtanen@helsinki.fi.
M.SC.Emmi Jokinen,Aalto大学
电子邮件:emmi.jokinen@aalto.fi.
赫尔辛基大学Satu Mustjoki教授bob体育下注安卓版
电子邮件:satu.mustjoki@helsinki.fi.
Harri教授Lähdesmäki阿尔托大学
电子邮件:harri.lahdesmaki@aalto.fi.
原文:Jokinen E,Huhtanen J,Mustjoki S,Heinonen M,LähdesmäkiH(2021)预测TCRGP与TCRGP的T细胞受体和表位之间的识别。PLO计算生物学17(3):E1008814。DOI:doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008814