芬兰研究人员开发的人工智能模型预测免疫系统的哪个键打开冠状病毒的锁
对于Aalto University和赫尔辛基大学的研究人员开发的人工智能(AI)方法,研究人员现在可以将免疫细胞链接到他们的目标,而是涉及哪种白细胞识别SARS-COV-2。bob体育下注安卓版开发工具具有广泛的应用,以了解免疫系统在感染,自身免疫障碍和癌症中的功能。

人类免疫防御是基于白细胞准确识别疾病导致病原体的能力,并引发防御反应。免疫防御能够召回以前遇到的病原体,例如,疫苗的有效性是基于的。因此,免疫防治是具有个人患者历史的最准确的患者记录系统。然而,此信息以前难以从患者样本中获得。

学习免疫系统大致可以分为两部分,其中B细胞负责产生针对病原体的抗体,而T细胞负责破坏它们的目标。用传统实验室方法测量抗体相对简单,这就是抗体在医疗保健中已经有多种用途的原因。

“虽然已知T细胞在防御反应中的作用反对例如病毒和癌症是必不可少的,但鉴定了尽管研究的广泛研究,但鉴定了T细胞的靶标。”satu nustjoki.,翻译血液学教授。

ai有助于识别新的键锁对

T细胞在键和锁定原理中识别它们的靶,其中键是T细胞表面上的T细胞受体,并且键是呈现在感染细胞表面上的蛋白质。估计个人携带更不同的T细胞键,而不是银河系中的恒星,使T细胞靶标具有繁琐的实验室技术。

因此,Aalto University和赫尔辛基大学的研究人员已经研究了以前分布bob体育下注安卓版的钥匙锁对,并且能够创建可以预测先前未映射的T细胞的目标的AI模型。

“我们创建的AI模型是灵活的,适用于每种可能的病原体 - 只要我们有足够的实验生产的钥匙锁对。例如,当有足够数量的这种对的这种成对的这种成对时,我们迅速将我们的模型应用于Coronavirus SARS-COV-2,“解释说emmi jokinen,M.Sc.和博士。Aalto大学的学生。

该研究的结果有助于我们了解T细胞如何应用其关键的不同部分来识别其锁。研究人员研究了哪些T细胞识别常见病毒,如流感,Hi-和乙型肝炎。研究人员还利用了他们的工具来分析鉴定乙型肝炎的T细胞的作用,这在肝炎进展到肝细胞癌后失去了杀伤能力。

该研究已在科学期刊上发表PLOS计算生物学

用新型AI型号发布数据的新生活

AI生成的工具是具有成本效益的研究主题。

“在这些工具的帮助下,我们能够更好地利用已发表的众多患者队列并获得额外的理解,”指出哈里Lahdesmaki,Aalto大学的计算生物学和机器学习教授。

使用人工智能工具,研究人员借出了防御反应的强度与其在不同疾病状态中的目标相关,没有这项研究,这是不可能的。

“例如,除了Covid19感染之外,我们还调查了防御系统在各种自身免疫疾病发展中的作用,并解释了为什么一些癌症患者受益于新药和一些不”,揭示了M.D。Jani Huhtanen.,博士。赫尔辛基大学的学生,关于即将到bob体育下注安卓版来的新模型的工作。

更多的信息

M.D.Jani Huhtanen,赫尔辛bob体育下注安卓版基大学
电话。+358 50 4350 191,电子邮件:Jani.huuhtanen@helsinki.fi.

M.SC.Emmi Jokinen,Aalto大学
电子邮件:emmi.jokinen@aalto.fi.

赫尔辛基大学Satu Mustjoki教授bob体育下注安卓版
电子邮件:satu.mustjoki@helsinki.fi.

Harri教授Lähdesmäki阿尔托大学
电子邮件:harri.lahdesmaki@aalto.fi.

原文:Jokinen E,Huhtanen J,Mustjoki S,Heinonen M,LähdesmäkiH(2021)预测TCRGP与TCRGP的T细胞受体和表位之间的识别。PLO计算生物学17(3):E1008814。DOI:doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008814