FINStruct

FINStruct标志

芬兰结构生物学和芬兰教学中心研究基础设施

结构生物学芬兰FINStruct)

FINStruct是一个全国性的、协调的、多机构的、开放获取的研究基础设施网络(以前的Instruct Finland, 2020年前的Instruct- fi)。它提供了综合结构生物学服务和培训支持生命科学的研究和创新。的核心设施提供FINStruct服务5所大学(赫尔辛基、奥卢、东芬兰、图尔库和Åbo Academi),由赫尔辛基大学协调。bob体育下注安卓版FINStruct包含在芬兰研究基础设施2014-2020路线图而且2021 - 2024年的路线图.FINStruct是芬兰生物中心结构生物学平台,并协调国家结构生物学网络的所有研究基础设施需求。

赫尔辛基大学FINStruct协调中心bob体育下注安卓版

FINStruct服务

FINStruct率先在国际研发生物分子复杂的净化(Biocomplex);低温电子显微镜(cryoEM);核磁共振(核磁共振);本机质谱(native-MS);结构生物信息学x射线晶体学而且数据管理.每个单位都是研究提供机构的核心设施。FINStruct服务于国内和国际的整个研究界、学术界和工业界。CryoEM、Biocomplex、NMR、SCoPE-MS、Biocenter Oulu和Biocenter Kuopio服务也可以通过Instruct-ERIC访问(见下文和资金的可能性Instruct-ERIC访问)。

芬兰Instruct-ERIC中心

Instruct-ERIC是欧洲研究基础设施战略论坛的成功经营者之一(ESFRI),是香港的地标ESFRI路线图(2016)。在科学评估和接受的基础上提供访问Instruct-ERIC中心分布在欧洲各地。Instruct- eric成员国主办指导中心,为指导中心的任务和目标提供基础设施和专业知识。directive - eric还提供了以下资源:

芬兰成为2019年成为Instruct-ERIC的正式成员.2020年2月,指导中心芬兰服务已开放,并可透过Instruct-ERIC目录国际和国家使用Instruct-ERIC新闻).FINStruct提供了一个分布式的芬兰指导中心,它是Instruct- eric的一个国家节点。作为Instruct-ERIC的成员,芬兰的科学家们可以访问世界各地目录尖端结构生物学技术,包括资金促成分子生物科学的重要研究发现。

芬兰指导中心服务

为Instruct-ERIC访问提供资金

看到资助的访问谁可以申请?

如何确认FINStruct和Instruct-ERIC

对于FINStruct或Instruct-ERIC中心芬兰访问和使用服务的所有发表和研究论文,都应该有FINStruct和/或Instruct-ERIC的确认。请在致谢中使用以下文本确认本服务、专业知识和资源的使用情况:

FINStruct和Instruct-ERIC: CryoEM, Biocomplex和NMR(赫尔辛基大学),Biocenter Oulu单位(奥卢大学)和Biocenter bob体育下注安卓版Kuopio单位(东芬兰大学)
作为芬兰Instruct-ERIC中心、FINStruct和芬兰生物中心的成员,“在X大学的RI设施名称”的设施和专业知识得到了感谢。
例子:作为芬兰Instruct-ERIC中心、FINStruct和芬兰生物中心的成员,赫尔辛基大学CryoEM实验室的设备和bob体育下注安卓版专业知识得到了衷心的感谢。

SCoPE-MS单位在Instruct-ERIC
芬兰赫尔辛基大学SCoPE-MS是芬兰Instruct-ERIC中心的成员之一,其设备和专业知识得到了衷bob体育下注安卓版心的感谢。

对于使用Instruct-ERIC接入资金的项目:看到指导方针在这里

服务单位在FINStruct:赫尔辛基大学和图尔库大学的蛋白质结晶设施,Åbo Akademi大学
FINStruct和芬兰生物中心的成员之一“X大学的RI设施名称”的设施和专业知识得到了感谢。
例子:赫尔辛基大学是FINStruct和芬兰生物中心的成员之一,其结晶设备和专业知识得到了非常感谢。bob体育下注安卓版

出版物

更新于2021年3月2日

2021

  1. Eesmaa A, Yu L-Y, Göös H, Nõges K, Kovaleva V, Hellman M, Zimmermann R, Jung M, Permi P, Varjosalo M, Lindholm P, Saarma M. 2021。细胞保护蛋白MANF促进神经元存活独立于GRP78辅助因子的作用。生物。化学,在出版社。
  2. 弗拉特,j.w.,多曼斯卡,A., Seppälä, a.l.,布彻,S.J. 2021。肠病毒前聚体口袋内保守的病毒粒子稳定网络的鉴定。审稿杂志。接受
  3. Georgakis N, Poudel N, Vlachakis D, Papageorgiou AC, Labrou NE。2021.Phi类谷胱甘肽转移酶对多种除草剂抗性的分子靶点:抑制分析和药效团设计。植物生理化学158:342-352。
  4. Gludovacz E, Schuetzenberger K, Resch M, Tillmann K, Petroczi K, Vondra S, Vakal S, Schosserer M, Virgolini N, Pollheimer J, Salminen TA, Jilma B, Borth N, Boehm t 2021。人二胺氧化酶在体外的细胞结合和内化以及体内的快速清除不是由n -聚糖介导的,而是由硫酸乙酰肝素蛋白聚糖相互作用介导的。糖生物学。cwaa090。Epub先于印刷。
  5. Kurkela J, Fredman J, Salminen TA, Tyystjärvi T. 2021。揭示神秘的细菌RNA聚合酶欧米伽亚基的秘密。摩尔Microbiol 115:1-11。
  6. Mustonen V, Muruganandam G, Loris R, Kursula P, Ruskamo S. 2021。NDRG1晶体和溶液结构,一种与髓鞘形成和肿瘤抑制相关的膜结合蛋白。2020年2月j。Epub先于印刷。
  7. Myllykoski M, Sutinen A, Koski MK, Kallio JP, Raasakka A, Myllyharju J, Wierenga RK, Koivunen P. 2021。跨膜脯氨酰4-羟化酶的结构揭示了EF和双加氧酶结构域的独特组织。J临床生物化学。Epub先于印刷。
  8. Papageorgiou AC, Poudel N, Matsson J. 2021。用x射线晶体学分析蛋白质。方法Mol. Biol. 2178:377-404。
  9. Platis M, Vlachakis D, Foudah AI, Muharram MM, Alqarni MH, Papageorgiou AC, Labrou NE。2021.之间的相互作用日本血吸虫谷胱甘肽转移酶的Cibacron blue 3GA及其片段。化学医学(出版中)
  10. Sowa ST, Moilanen A, Biterova E, Saaranen MJ, Lehtiö L, Ruddock LW。高分辨率晶体结构的人pERp1,一个参与IgA, IgM和整合素在内质网成熟的皂苷样蛋白。生物化学杂志,2021。Epub先于印刷。
  11. 施瓦泽S,罗德里格斯-佛朗哥M,奥克萨宁HM, Quax TEF。2021.与生长期相关的盐珠藻细胞形态。微生物,9:231。
  12. Tittes C, Schwarzer S, Pfeiffer F, Dyall-Smith M, Rodriguez-Franco M, Oksanen HM, Quax TEF。2021.广筋古菌病毒HFTV1宿主吉氏Haloferax gibbonsii LR2-5的细胞和基因组特性前面。Microbiol。在新闻
  13. Wazir S, Maksimainen MM, Alanen HI, Galera-Prat A, Lehtiö L. 2021。基于活性的单adp核糖体水解酶筛选试验。sla。26:67 - 76。

2020

  1. Asthana P, Singh D, Pedersen JS, Hynönen MJ, Sulu R, Murthy VA, Laitaoja M, Jänis J, Riley LW, Venkatesan R. 2020。结核分枝杆菌哺乳细胞进入(Mce) 1和4复合物底物结合蛋白的结构研究。BioRxiv。doi:https://doi.org/10.1101/2020.09.29.317909
  2. Ashok Y, Maksimainen MM, Kallio T, Kilpeläinen P, Lehtiö L. 2020。嗜酸乳球菌乳酸氧化酶的fmn依赖寡聚反应。《公共科学图书馆•综合》。15:e0223870。
  3. Ashok Y, Miettinen M, Oliveira DKH, Tamirat MZ, Näreoja K, Tiwari A, Hottiger MO, Johnson MS, Lehtiö L, Pulliainen AT。2020.发现抑制百日咳毒素adp核糖转移酶活性的化合物。ACS感染Dis. 6:588-602。
  4. Barrass SV, Butcher SJ。高通量病毒受体鉴定方法的研究进展。2020.医学微生物免疫学209:309-323。
  5. Barylski J、Enault F、Dutilh BE、Schuller MBP、Edwards RA、Gillis A、Klumpp J、Knezevic P、Krupovic M、Kuhn JH、Lavigne R、Oksanen HM、Sullivan MB、Jang HB、Simmonds P、Aiewsakun P、Wittmann J、Tolstoy I、Brister JR、Kropinski AM、Adriaenssens EM. 2020。spounavirus作为尾状噬菌体过期重分类的案例分析系统生物69:110 - 123。
  6. 本德斯AA,库苏拉P,库苏拉i。疟原虫非典型同二聚体肌动蛋白盖层蛋白的结构。BioRxiv。doi:https://doi.org/10.1101/2020.08.16.253187
  7. HM, Mikula KM, Li M, Wlodawer A, Iwaï H. 2020。自然分裂的gp41-1蛋白的晶体结构指导着顺式剪接蛋白的正交分裂蛋白工程。2月j . 287:1886 - 1898。
  8. 拜尔HM, Virtanen SI, Aranko AS, Mikula KM, Lountos GT, Wlodawer A,奥利拉OHS, Iwaï H. 2020。在不同的蛋白质剪接机制中,hedgehog/ interin的聚合。国际化学杂志。
  9. Carvalho DMD, Lahtinen, MH, Lawoko M, Mikkonen KS。2020.针叶木提取物中木质素-碳水化合物的富集与鉴定,ACS可持续化学。Eng。8:11795 - 11804
  10. Ciragan A, Backlund SM, Mikula KM, Beyer HM, Ollila OHS, Iwaï H. 2020。利用盐诱导分裂位点的无瘢痕节段同位素标记研究了TonB的核磁共振结构和动力学。前面。化学8:136。
  11. Cuellar J, Åstrand M, Elovaara H, Pietikäinen A, Sirén S, Liljeblad A, Guédez G, Salminen TA, Hytönen J. 2020。对伯氏疏螺旋体BmpD的结构和生物分子分析揭示了一个abc型核苷转运蛋白家族的底物结合蛋白。感染Immun。88:e00962-19。
  12. De S, Pollari M, Varjosalo M, Mäkinen K. 2020。宿主蛋白静脉曲张与多蛋白复合物内的HCPro的关联对马铃薯a病毒感染的RNA沉默抑制、翻译、包壳和系统传播至关重要。公共科学图书馆Pathog。16:e1008956。
  13. Demina TA, Oksanen HM。2020.多形性古细菌病毒:多形性古病毒科增加了7个新物种。拱性。165:2723 - 2731。
  14. 弗拉特,j.w.,多曼斯卡,a., Seppälä, a.l.,布彻,S.J. 2020。肠病毒前聚体口袋内保守的病毒粒子稳定网络的鉴定。BioRxiv: doi:https://doi.org/10.1101/2020.07.06.189373
  15. Georgakis N, Poudel N, Papageorgiou AC, Labrou NE。2020.禾草和农作物抗多除草剂过程中phi类谷胱甘肽转移酶的结构和功能比较分析。植物生理化学149:266-276。
  16. Harrus D, Harduin-Lepers A, Glumoff T. 2020。高分辨率人α-2,6-唾液酰基转移酶ST6Gal I的非配体和CMP-Neu5Ac结合结构。生物化学。212:107628
  17. Heliste J, Chheda H, Paatero I, Salminen TA, Akimov Y, Paavola J, Elenius K, Aittokallio T. 2020。心力衰竭外显子TRIM55变异的遗传和功能意义J Mol Cell Cardiol. 138:222-233。
  18. Hongisto H, Dewing JM, Christensen DR, Scott J, Cree AJ, Nättinen J, Määttä J, Jylhä A, Aapola U, Uusitalo H, Kaarniranta K, Ratnayaka JA, Skottman H, Lotery AJ。2020.体外干细胞模型证明了功能过剩的突变体TIMP3是Sorsby基底营养不良症的原因。中草药。252:138 - 150。
  19. Jaakkonen A, Volkmann G, Iwaï H. 2020一种在体外通过蛋白质反式剪接生成选体来生产Fc融合蛋白的现成方法。Int。化学学报,21:409。
  20. 姜明,Österlund P, Poranen MM, Julkunen I. 2020。体外合成病毒rna的生产及其进入哺乳动物细胞和病毒rna在先天干扰素反应研究中的应用。方法。183:21-29。
  21. Johansson MM, Bélurier E, Papageorgiou AC, Sundin AP, Rahkila J, Kallonen T, Nilsson UJ, Maatsola S, Nyholm TKM, Käpylä J, Corander J, Leino R, Finne J, Teneberg S, Haataja S 2020。毒力因子的结合机制猪链球菌粘附蛋白P亚型到球状四糖基神经酰胺与全身疾病相关。生物。化学。295:14305 - 14324
  22. Johansson MM, Bélurier E, Papageorgiou AC, Sundin AP, Rahkila J, Kallonen T, Nilsson UJ, Maatsola S, Nyholm TKM, Käpylä J, Corander J, Leino R, Finne J, Teneberg S, Haataja S 2020。毒力因子的结合机制猪链球菌粘附蛋白P亚型到球状四糖基神经酰胺与全身疾病相关。bioRxiv 2020.05.29.122762;doi:https://doi.org/10.1101/2020.05.29.122762
  23. Johansson NG, Turku A, Vidilaseris K, Dreano L, Khattab A, Ayuso Pérez D, Wilkinson A, Zhang Y, Tamminen M, Grazhdankin E, Kiriazis A, Fishwick wg, Meri S, Yli-Kauhaluoma J, Goldman A, Boije Af Gennäs G, Xhaard H. 2020。从异恶唑片段衍生的膜结合焦磷酸酶抑制剂的发现。ACS医学化学Lett, 11:605-610。
  24. Kalke K, Lehtinen J, Gnjatovic J, Lund LM, Nyman MC, Paavilainen H, Orpana J, Lasanen T, Frejborg F, Levanova AA, Vuorinen T, Poranen MM, Hukkanen V. 2020。单纯疱疹病毒1型临床分离物响应ul29靶向siRNA群治疗独立于其无环鸟苷敏感性。病毒。12:1434。
  25. Karki S, Shkumatov AV, Bae S, Kim H, Ko J, Kajander T. 2020。SALM3二聚体的结构基础与PTPσ形成突触粘附复合物。Sci众议员10:11557。
  26. Kukkurainen S, Azizi L, Zhang P, Jacquier MC, Baikoghli M, von Essen M, Tuukkanen A, Laitaoja M, Liu X, Rahikainen R, Orłowski A, Jänis J, Määttä JAE, Varjosalo M, Vattulainen I, Róg T, Svergun D, Cheng RH, Wu J, Hytönen VP, Wehrle-Haller B. 2020。talin头部区域的F1环在整合素的激活和聚集中起着守门人的作用。中国生物医学工程学报,32(3):332 - 336。
  27. Leppänen VM, Brouillard P, Korhonen EA, Sipilä T, Jha SK, Revencu N, Labarque V, Fastré E, Schlögel M, Ravoet M, Singer A, Luzzatto C, Angelone D, Crichiutti G, D’elia A, Kuurne J, Elamaa H, Koh GY,萨哈里宁P, Vikkula M, Alitalo K. 2020。描述的ANGPT2与原发性淋巴水肿相关的突变。中国生物医学杂志。
  28. Levanova AA、Kalke KM、Lund LM、Sipari N、Sadeghi M、Nyman MC、Paavilainen H、Hukkanen V、Poranen MM. 2020。酶促合成的2'-氟修饰dicer底物siRNA群对单纯疱疹病毒具有增强的抗病毒疗效和低的细胞毒性。抗病毒182:104916》。
  29. Laurinmäki, P., Shakeel, S., Ekström, J., Mohammadi, P., Hultmark, D., Butcher, s.j (2020) 2.7 Å分辨率诺拉病毒的结构及其受体结合、衣壳稳定性和分类的意义。科学报告10:19675https://doi.org/10.1038/s41598-020-76613-1
  30. Mahato AK、Kopra J、Renko JM、Visnapuu T、Korhonen I、Pulkkinen N、Bespalov MM、Domanskyi A、Ronken E、Piepponen TP、Voutilainen MH、Tuominen RK、Karelson M、Sidorova YA、Saarma M 2020。胶质细胞系衍生的神经营养因子受体在转染激动剂期间重排支持体外多巴胺神经元和增强体内多巴胺释放。Mov Disord。35:245 - 255。
  31. Mattila ALK, Jiggins CD, Opedal ØH, Montejo-Kovacevich G, de Castro É, McMillan WO, Bacquet C, Saastamoinen M. 2020。Heliconius butterfly的化学防御具有高度的进化潜力,bioRxiv 2020.01.14.905950
  32. Mofikoya OO, Mäkinen M, Jänis J. 2020。针叶树挥发油和溶剂提取物的超高分辨率傅里叶变换离子回旋共振质谱化学指纹分析。ACSω。5:10543 - 10552。
  33. Myllykoski M, Sutinen A, Koski MK, Kallio JP, Raasakka A, Myllyharju J, Wierenga R, Koivunen p 2020。跨膜脯氨酰4-羟化酶的结构揭示了EF和双加氧酶结构域的独特组织。BioRxiv。doi:https://doi.org/10.1101/2020.10.25.354423
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  36. Nji Wandi B, Siitonen V, Dinis P, Vukic V, Salminen TA, Metsä-Ketelä M. 2020。参与诺加拉霉素生物合成的非血红素铁酶的进化指导工程。2月j . 287:2998 - 3011。
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  38. Orengo C、Velankar S、Wodak S、Zoete V、Bonvin AMJJ、Elofsson A、Feenstra KA、Gerloff DL、Hamelryck T、Hancock JM、Helmer-Citterich M、Hospital A、Orozco M、Perrakis A、Rarey M、Soares C、Sussman JL、Thornton JM、Tuffery P、Tusnady G、Wierenga R、Salminen T、Schneider b。在ELIXIR (3D-Bioinfo community)中整合结构生物信息学活动的社区提议。F1000Res。9:灵丹妙药- 278。
  39. Papageorgiou AC, Mohsin I. 2020。SARS-CoV-2刺突糖蛋白作为药物和疫苗靶点:其与ACE2和抗体的复合物的结构洞察。细胞9:2343。
  40. Premetis G, Marugas P, Fanos G, Vlachakis D, Chronopoulou EG, Perperopoulou F, Dubey KK, Shukla P, Foudah AI, Muharram MM, Aldwsari MF, Papageorgiou AC, Labrou NE。2020.靶向抗癌药物秋水仙碱的微管与人谷胱甘肽转移酶的相互作用。Curr Pharm Des 26: 5205-5212
  41. Saari H, Turunen T, Lõhmus A, Turunen M, Jalasvuori M, Butcher SJ, Ylä-Herttuala S, Viitala T, Cerullo V, Siljander PRM, Yliperttula M. 2020。细胞外囊泡为溶瘤腺病毒DNA传递提供无衣壳载体。J Extracell囊泡。9:1747206。
  42. sha - teli SK, Hynönen MJ, Sulu R, Dalwani S, Schmitz W, Wierenga RK, Venkatesan R. 2020。大肠杆菌有氧β-氧化三功能酶复合物的稳定性和底物特异性的研究。生物化学。210:107494。
  43. Seifert M, van Nies P, Papini FS, Arnold JJ, Poranen MM, Cameron CE, Depken M, Dulin D. 2020。温度控制的高通量磁性镊子复制病毒RNA依赖的RNA聚合酶的活化能差异显著。中国生物医学工程学报。
  44. Seifert M, van Nies P, Papini FS, Arnold JJ, Poranen MM, Cameron CE, Depken M, Dulin D. 2020。温度控制的高通量磁性镊子复制病毒RNA依赖的RNA聚合酶的活化能差异显著。bioRxiv 2020.01.15.906032
  45. Sridhar S, Schmitz W, Hiltunen JK, Venkatesan R, Bergmann U, Kiema TR, Wierenga RK。2020.大鼠过氧化物体多功能酶1与3-酮癸酰辅酶a的晶体结合研究:捕获其水合酶和脱氢酶催化位点的活性和非活性状态。生物学报,32(3):357 - 361。
  46. Sirén S, Dahlström KM, R . Puttreddy, K . Rissanen, TA . Salminen, M . Scheinin, Li XG, A. Liljeblad . 2020。用于PET成像的高度紧张的4-二苯并环辛基醇(DIBO)的假丝酵母南极洲脂肪酶基对映识别。分子。25:879。
  47. Sowa ST, Vela-Rodríguez C, Galera-Prat A, Cázares-Olivera M, Prunskaite-Hyyryläinen R, Ignatev A, Lehtiö L. 2020。一种基于fret的高通量筛选平台,用于发现靶向人类tankyrases脚手架功能的化学探针。Sci众议员10:12357。
  48. Storey D, McNally A, Åstrand M, Sa-Pessoa Graca Santos J, Rodriguez-Escudero I, Elmore B, Palacios L, Marshall H, Hobley L, Molina M, Cid VJ, Salminen TA, Bengoechea JA。2020.肺炎克雷伯菌VI型分泌系统介导的微生物竞争受PhoPQ控制,并依赖于活性氧。公共科学图书馆Pathog。16:e1007969。
  49. Thapa R, Nissinen T, Turhanen P, Määttä J, Vepsäläinen J, Lehto V-P, Riikonen J. 2020。双膦酸盐改性介孔硅吸附钪。微孔和介孔材料
  50. Tittes C, Schwarzer S, Pfeiffer F, Dyall-Smith M, Rodriguez-Franco M, Oksanen HM, Quax TEF。2020.广筋古菌病毒HFTV1宿主吉氏Haloferax gibbonsii LR2-5的细胞和基因组特性bioRxiv。2020.10.26.354720
  51. Tuusa J, Koski MK, Ruskamo S, Tasanen K. 2020。BP180/胶原XVII的胞内结构域本质上是紊乱的,并在阴离子膜模拟脂质的环境中部分折叠。氨基酸。52:619 - 627。
  52. Vakal S, Jalkanen S, Dahlström KM, Salminen TA2020.药物设计与开发中的人体含铜胺氧化酶。分子。25:1293。
  53. Valanne S, Järvelä-Stölting M, Harjula SE, Myllymäki H, Salminen TS, Rämet M. 2020。含osa的brahma复合体调节果蝇先天免疫和代谢基因的表达。J Immunol。204:2143 - 2155。
  54. Viisanen H, Nuotio U, Kambur O, Mahato AK, Jokinen V, Lilius T, Li W, Santos HA, Karelson M, Rauhala P, Kalso E, & Sidorova YA。2020.治疗实验性神经疾病的新型RET激动剂。分子16:1744806920950866疼痛。
  55. Virtanen SI, Kiirikki AM, Mikula KM, Iwaï H,奥利拉OHS。2020.部分无序蛋白质的异质性动力学。理论物理。化学。化学。理论物理22:21185 - 21196。
  56. Wang L, Borghei M, Ishfaq A, Lahtinen P, Ago M, Papageorgiou AC, Lundahl M, Johansson LS, Kallio T, Rojas OJ。2020.介孔炭微纤维的电活性材料的来源木质素纳米纤维素ACS维持化学工程8(23):8549-8561。
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  58. 张鹏,Azizi L, Kukkurainen S,高涛,M Baikoghli, Jacquier MC,孙毅,Määttä JAE,郑浩然,Wehrle-Haller B, Hytönen副总裁,吴杰2020。ferm折叠的塔林头部的晶体结构揭示了整合素结合的决定因素。中国科学院学报(自然科学版)117:32402-32412。

2013 - 2021、见下面的PDF。